13 Reasons Why ha generado polémica desde su primera temporada por su tratamiento de temas como el suicidio adolescente, el abuso sexual y la violencia. El episodio final de la segunda entrega mostró una de las escenas más controvertidas, protagonizada por Dylan Minnette, quien ha querido responder a las críticas durante una entrevista.
En la comentada escena, Clay trata de evitar un tiroteo en el instituto. En lugar de avisar a las autoridades, el protagonista se enfrenta a Tyler, el tirador, poniendo así en riesgo su vida.
La controversia en torno a la segunda temporada se centró casi exclusivamente en el personaje de Tyler, víctima de bullying durante las dos entregas de la ficción de Netflix. Él es el protagonista de una de las escenas más brutales, en la que es agredido sexualmente por varios compañeros. Es esto lo que lleva a Tyler a planear un tiroteo en el instituto, pero finalmente Clay le disuade.
A pesar de la polémica 13 Reasons Why ha renovado para una tercera temporada en Netflix, aún sin fecha de estreno.