Además de esos interrogantes, no se ha esclarecido por qué el Ejército decidió seguir adelante con el operativo en medio de un bazar comunitario con decenas de civiles y varios niños y niñas en el lugar. Igualmente, si los cuerpos de las víctimas fueron alterados después del ataque, como lo evidenciaría una serie de fotografías del cuerpo de Brayan Santiago Pama, en las que se observa que habría sido arrastrado y le habrían puesto un fusil después de muerto.
Las preguntas quedan sin resolver luego de la investigación Las inconsistencias del operativo militar en Putumayo que cobró la vida de civiles, publicada en alianza con la revista Cambio y el medio Vorágine.